Workshop 1: Mesure de la fluorescence de la chlorophylle

Objectifs: 1) Comprendre comment à partir de la mesure de la fluorescence de la chlorophylle, l’activité photosynthétique est évaluée; 2) Comprendre comment l’énergie absorbée est gérée par les chloroplastes; 3) Réaliser et analyser des mesures

Animé par Benoît Schoefs (BIOSSE) et Isabelle Mary (LMGE).

Descriptif: 

Une fraction de l’énergie absorbée par la chlorophylle n’est pas utilisée pour la photosynthèse et est réémise sous forme de fluorescence. L’intensité de l’émission de la fluorescence varie dans le temps en fonction des conditions environnementales. Du point de vue de la physiologie des organismes photosynthétiques, ces variations reflètent la manière dont ils gèrent l’énergie absorbée

La journée de formation se découpe en deux temps :

(1)    une description théorique de la photosynthèse, de la fluorescence de la chlorophylle et de l’utilisation des variations de l’intensité de la fluorescence pour la mesure de l’activité photosynthétique et la gestion du stress (2-3h)

(2)    travaux pratiques sur des échantillons proposés et/ou apportés par les participants eux-mêmes.

 

Ce workshop aura lieu le lundi 7 septembre 2026 de 11h à 18h.

 

Frais d’inscription : 60 € HT par participant (TVA non applicable)

 

Ce prix comprend l’accès au workshop, le polycopié de la présentation et le repas de midi et la pause café.

Workshop 2: Métabarcoding diatomées : clés de lecture et bonnes pratiques pour mieux comprendre ses inventaires

Avec l’essor et le déploiement opérationnel du métabarcoding, de plus en plus d’acteurs produisent et/ou interprètent des inventaires génétiques et taxonomiques (ADNe) produits à partir de biofilm aquatique pour caractériser les diatomées benthiques. En l’absence d’un cadre clair permettant d’identifier les bonnes pratiques ou les informations réellement pertinentes associées à la production de ces inventaires, il peut être difficile d’interpréter les résultats obtenus. Ce workshop d’une demi‑journée vise à apporter des éléments de réponse à ces besoins.

Animé par Valentin Vasselon (SCIMABIO INTERFACE). 

1) La première partie du workshop proposera un volet pratique sur l’analyse bioinformatique de données de métabarcoding, en mettant l’accent sur les paramétrages clés pouvant affecter les inventaires génétiques et taxonomiques produits (paramètres de PCR/séquençage, base de référence, assignation taxonomique). L’objectif est que les participants acquièrent des réflexes de base pour interpréter des données issues du métabarcoding.

 2) La seconde partie sera consacrée à un temps d’échange interactif autour des retours d’expérience des participants et de leurs propres données lorsqu’ils en disposent. L’objectif est d’identifier collectivement les points bloquants sur différents types de données afin de renforcer la capacité de chacun à analyser et interpréter ses résultats. Au besoin, les participants pourront envoyer leurs données et problématiques en amont du workshop à l’animateur pour faciliter les échanges le jour J. »

 

Frais d’inscription : 300 € HT par participant (TVA non applicable)

 

Ce workshop aura lieu le lundi 7 septembre 2026 de 13h à 18h.

 

Ce prix comprend l’accès au workshop, le polycopié de la présentation et la pause café.

Workshop 3: Taxonomie

Un workshop sur le genre Nitzschia aura lieu au même site les jeudi 10 septembre après-midi et vendredi 11 septembre matin, animé par le Professeur Bart Van de Vijver (Jardin Botanique National de Belgique) et co-organisé Carlos Wetzel (LIST).

 

Frais d’inscription : 225 € HT par participant (TVA non applicable)  ( 115€ HT pour les étudiants )

Ce prix comprend l’accès au workshop, le polycopié de la présentation et les pauses café.